Пятый сезон американского комедийного телесериала «Клиника» стартовал на канале NBC 3 января 2006 года, завершился 16 мая 2006 года и состоит из 24 эпизодов. На протяжении первых двенадцати эпизодов, каждый вторник в 21:00 (по местному времени) транслировались сразу две новые серии подряд. Впоследствии, NBC вернулся к формату одной новой серии в неделю, за которой следовала повторная трансляция прошлых эпизодов. В качестве особых гостей в пятом сезоне появились Джейсон Бейтман и Мэнди Мур, а также были введены новые регулярные персонажи, сыгранные Элизабет Бэнкс и Трэвисом Шульдтом. Пятый сезон был номинирован на премию «Праймтайм Эмми» в категории «Лучший комедийный сериал».
Сезон 5 начинается с того, что Джон Дориан (Джей-Ди) живет в гостинице. Теперь он стал врачом-практикантом, находясь на равных с доктором Коксом. В премьерном эпизоде сезона Эллиот принимает участие в новой стажировке в другой больнице, но в следующем эпизоде ее увольняют. В итоге, Эллиот возвращается в «Сакред Харт» и становится опытным врачом. Тем временем, Турк и Карла пытаются завести ребенка, хотя у Турка все еще есть сомнения. Параллельно в «Сакред Харт» прибывают новые стажеры, в числе которых — Кит Дудемайстер.
Пятый сезон особенно акцентирует внимание на отношениях между Джей-Ди и доктором Коксом, которые теперь являются коллегами на равных.